2021年，与西安西京医院合作完成的《糖尿病患者早筛、干预治疗及其肠道菌群研究》系列项目，发表在学术期刊Genome medicine 和Frontier in cellular and infection microbiology 上。

2021年，联合上海瑞金医院内分泌科以及上海神经科学研究所合作完成的《肠道菌群与全脑功能连接在减肥手术中的作用》项目，发表在学术期刊The Journal of Clinical Endocrinology & Metabolism上。

2020年，与徐州医科大学附属医院合作完成的《肺部菌群与肺癌之间的关联研究》以及《菌群在黏液层上的综述》项目，发表在学术期刊Translational Lung Cancer Research 和 Gut Microbes上。

2019年，与上海华山医院和南京皮研所合作完成的《特应性皮炎患者皮肤，口腔，肠道菌群研究》项目，发表在顶级学术期刊 Journal of Investigative Dermatology 上。

2017年，与上海瑞金医院合作完成的《中国青少年肥胖多组学研究》项目，发表在顶级学术期刊Nature medicine上。

2017年，与上海瑞金医院合作完成的《肠道菌群与糖尿病精准用药研究》项目，发表在顶级学术期刊Nature communication上。

2017年，与中国科学院大学合作完成的《二型糖尿病与肠道菌群标记物的挖掘》项目，发表在学术期刊Antonie van Leeuwenhoek 上。

2016年，与伦敦大学国王学院合作完成的《遗传与环境对肠道微生物的影响》项目，发表在顶级学术期刊Cell Systems上。

2015年，与北京协和医院合作完成的《类风湿性关节炎与口腔，肠道菌群之间的关联》项目，发表在顶级学术期刊Nature medicine上。

2015年，与香港中文大学合作完成的《结直肠癌与肠道微生物关联研究》项目，发表在顶级学术期刊Gut 上。

2015年，与哥德堡大学合作完成的《肠道菌群在婴儿第一年的动态演变》项目，发表在顶级学术期刊Cell Host & Microbe上。

2021年11月，与上海华山医院、南京皮肤病研究所共同完成的研究“A New Formulation of Probiotics Attenuates Calcipotriol-Induced Dermatitis by Inducing Regulatory Dendritic Cells”在Frontiers in Immunology 发表。该研究对零一生命旗下因微健益生菌进行了深度研究，并验证和阐明了其预防与改善特应性皮炎的机制与效果。

2022年，与瑞金医院合作完成的“Butyrate-Producing Eubacterium rectale Suppress LymphomagenesisBy alleviating the TNF-induced TLR4/MyD88/NF-κB axis”项目，在学术期刊Cell host & microbe 发表。

该研究首次利用宏基因组学手段揭示了肠道菌群-代谢物-免疫调节轴在炎症相关淋巴瘤中的机制，并为靶向肠道菌群治疗相关炎症性疾病提供了潜在的临床依据。

2023年6月2日，零一生命科研团队联合中国医学科学院皮肤病研究所、上海华山医院皮肤科合作完成的研究“Heterogeneous regulation of Staphylococcus aureus by different Staphylococcus epidermidis agr types in atopic dermatitis”在皮肤科领域著名期刊Journal of Investigative Dermatology上发表。

2023年8月25日，零一生命科研团队联合中国医学科学院皮肤病研究所、上海华山医院皮肤科在皮肤微生态领域的研究成果“Differential changes in the gut microbiota between extrinsic and intrinsic atopic dermatitis”在免疫学领域顶级期刊Journal of Autoimmunity上发表。

2023年12月19日，零一生命联合中国医学科学院皮肤病医院姚煦教授团队和复旦大学附属华山医院李巍教授团队以及美国约翰霍普金斯大学冷晓教授合作在Cell Reports Medicine杂志在线发表题为Attenuation of allergen-specific immunotherapy for atopic dermatitis by ectopic colonization of Brevundimonas vesicularis in the intestine的研究。

2024年06月26日，零一生命联合复旦大学附属华山医院李巍教授团队和中国医学科学院皮肤病医院姚煦教授团队以及香港城市大学董立新教授在Cell Host & Microbe发表了题为Multi-omics Signatures Reveal Genomic and Functional Heterogeneity of Cutibacterium acnes in Normal and Diseased Skin的研究论文。